申请办理婚前财产协议公证的方式是：

1、双方必须共同亲自到公证处提出公证申请，填写申请表格；

2、公证申请被公证员受理后，公证员会对婚前财产协议书的内容进行询问，双方配合公证员做完公证谈话笔录，并在笔录上签字确认；

3、双方在公证员面前亲笔签署婚前财产协议书；

4、当事人可在规定的期限日凭收费单据到公证处领取公证书。

【法律依据】

根据《婚姻法》第十九条，夫妻可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或部分各自所有、部分共同所有。约定应当采用书面形式。