天然蛋白质的合成过程是：基因→表达(转录、翻译)→形成具有氨基酸序列的多肽链→形成具有高级结构的蛋白质→行成生物功能。天然蛋白质是不经过人工的任何修饰或加工的。蛋白质工程是以蛋白质分子的结构规律及其与生物功能的关系作为基础，通过基因修饰答或基因合成，对现有的蛋白质进行改造，或制造一种新的蛋白质，以满足人类的生产和生活的需求。