乌龟用肺呼吸，且肺部发达，能吞入大量空气。乌龟的肺在甲壳下面，不能直接呼吸空气，必须靠口腔下方的一升一降把空气吞入口腔，然后再送往肺里，与吞咽食物相似。

乌龟呼吸时同时要靠其四肢与腹部起伏才能带动其肺呼吸，它的泄殖腔两侧的肛门囊，可在水中进行气体交换，所以它可以在水中长时间生活。