第一部结局：最后太一他们几个人回到原来的现实世界，数码宝贝们留在数码世界，孩子们与他们的数码宝贝分开。

第二部结局：变种吸血魔兽被打败，及川悠纪夫有了自己的数码宝贝，但是他看到数码世界被破坏，就牺牲自己，使数码世界复原了，被植入黑暗种子的孩子们也找回了梦想，并得到了他们的数码宝贝。然后是二十年后的事情， 数码宝贝被世界所认可，每个人都有自己的数码宝贝伙伴。太一成了企业家；阿和成了宇航员；大辅开了拉面馆；小贤和小京结婚了，有三个小孩；嘉儿当了幼儿园老师；阿武成了小说家；伊织成了律师。

第三部结局：树莉把数码器指向帝厉魔的墙壁，数码器便射出耀眼的光芒。此时，红莲骑士兽正在和帝厉魔展开壮绝的生死决战。尽管把它们一只只地打倒，但仍无法靠近树莉所在的地方，但这个时候，一团赤黑的黏液流进室内，液体填满了树莉所在的球体，夺去了她逃走的地方。

第四部结局：拓也他们合体为金刚武神兽，打败了六翅兽，再后来他们与斗士精神告别，回到了现实世界。