1、从综合实力来说，南京大学要比厦门大学好一些，但是从偏向经济或是理科一类的专业来说，厦大大学会比南京大学好些；

2、南京大学是中国现代科学的发祥地之一，是哈佛大学白碧德主义影响下的中国“学衡派”的雅集地，被誉为“中国科学社的大本营和科学发展的主要基地”，是“985工程”首批九所高水平大学中唯一未合并其他院校的高校，坚持“内涵发展”，赢得社会“中国最温和的大学”之美誉；

3、厦门大学简称厦大，由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，是国内最早招收研究生的大学之一，被誉为“南方之强”。学校是中华人民共和国教育部直属的副部级大学，教育部、福建省和厦门市共建高校[2]，是世界一流大学建设高校。