1、益生菌不能与抗生素类药物或者吸附性药物同时使用。益生菌绝大多数是活的有益性的细菌。比如双歧杆菌，酪酸梭菌，枯草杆菌肠球菌等。当与抗生素同时使用时，会降低益生菌的活性。

2、与吸附性药物同时使用时，会导致益生菌被排出体外，降低疗效。 建议使用益生菌时与抗生素间隔两个小时以后再服用。与吸附性药物同时使用时最少间隔一个小时。服用益生菌时要用温开水，不能用热水，防止降低活性。