南通理工学院是经国家教育部、江苏省人民政府、江苏省教育厅批准独立设置的具有颁发高等教育学历文凭资格的全日制民办普通本科高校，也是南通市第一所民办高校。

南通理工学院的前身是紫琅职业技术学院，是2000年6月经江苏省人民政府批准创建、教育部备案的一所全日制民办普通高等职业院校；2007年以良好的成绩通过高职高专人才培养工作水平评估；2012年6月开始由江苏江海科教开发有限公司与江苏省教育厅直属教育发展投资中心共同举办，2013年4月获得民办事业单位法人证书，成为江苏省第一所民办事业单位法人高校；2013年年底，学院成为全国非营利性民办高校联盟26个发起单位之一。