1、随着一周目的结束，主角也就会到了自己家，但这正意味着新的旅途的开始。

2、下楼后，会出现2个妈妈。她们会说起你碰到了2只传说中PM的事情。下面一个妈妈脱掉伪装露出了自己的真面目，原来他是神奥的国际刑警Handsome (汉森)。他会赞扬主角和馆主的活跃，使等离子团的城堡毁灭了，部下散的散逃的逃。

但是七贤者依然潜伏在伊修大陆的各个地方，所以冠军推荐你参与汉森的调查。

同意协助他调查，得到超级钓竿。Handsome介绍钓竿用法后离开。

3、随即你就要去寻找六位贤者。出门后遇到两位劲敌。于是乎图鉴升级升级图鉴之后，基本只剩下支线剧情。来到第四个道馆的城镇，有很多设施的那个(精灵中心上面的左边一座民宅一楼左边的人可以拿秘传04怪力)，往右走过一段路到一座桥上，会遇到三个瞬移男，他们会给你金刚石，白玉，白金玉之后瞬移离开。

4、继续走会遇到一个研究所，该研究所是与前作联动的捕获地点，之后，研究院看见你身上有所有的勋章，然后惊讶了一番，便请你使用机器(DP，PT，HGSS)的PM传送过来，但是PM身上不能携带道具。

5、往右走过一座城市直接往右上出去，然后往上，在去新城市的门口找左边度假的少女谈话拿到秘传机器06潜水!在深的地方可以潜水，但只能去海底遗迹。海底遗迹在该城市右边海域，在上面的房子里可以遇到前作的冠军希罗娜，选是展开对战!