西南交通大学研究生学科目前已涵盖工、理、管、经、文、法、农、医等13个学科门类，拥有2个一级学科国家重点学科，10个二级学科国家重点学科，交通运输工程一级学科排名稳居全国第一，“测绘科学与技术”、“土木工程”、“电气工程”、“机械工程”、“管理科学与工程”等学科位居全国前列。共有56个博士学位授权点、138个硕士学位授权点，在校研究生人数1万余名。

2017年博士研究生毕业生就业率为百分之九十九点零五，签约月收入较高的专业为软件工程，数学与应用数学，网络工程，物流管理，信息安全。